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MAGIC(Multiparent Advanced Generation Inter-Cross)作图群体

已有 14710 次阅读 2011-5-30 15:10 |系统分类:科研笔记|关键词:学者

     MAGIC(Multiparent Advanced Generation Inter-Cross):魔术(magic)一般的作图群体。MAGIC:多亲本高级世代互交系。MAGIC是一种比我们通常用的F2、RIL、CSSLs(两个亲本获得)等作图群体更为复杂的作图群体。但是MAGIC的一个重要特点正是因为其应用了多亲本互交,由此不会出现后代多态性下降,后代衰退的现象,可能从某种意义上说更加先进,杂种优势更加明显,但是由于其实在太复杂,这样的群体结构比较难于把握,同时获得这样一个作图群体也需要耗费多年的时间才能完成。这种群体和NAM(Nested Association Mapping)作图群体倒是更为类似。当然其名气和NAM还相差很大。
如Kover 等(2009)

A Multiparent Advanced Generation Inter-Cross to fine-map quantitative traits in.pdf

利用1 026个SNP标记对一个多亲本高级世代互交系(multiparent advanced generation intercross,
MAGIC)群体(为19个拟南芥材料相互杂交构建的群体)进行了全基因组扫描, 分析结果证实, 利用此群体定位的QTL与已知的QTL极为接近, 说明应用此类等位基因有限群体进行全基因组扫描功效更高且更加精确。
目前拥有MAGIC群体的物种并不是很多,其中小麦中比较经典 MAGIC Populations in Wheat:http://www.niab.com/pages/id/93/MAGIC_Populations_in_Wheat

 



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1 王平喜

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