使用maxAlike - web server重建未知序列

 

熊荣川

xiong rongchuan

六盘水师范学院生物信息学实验室

xiongrongchuan@126.com

http://blog.sciencenet.cn/u/Bearjazz

 

 

最近有个可以通过系统发育推断法重建未知序列的算法问世，通过已知的系统发育树，和树上若干树梢上的已知序列重建某一个未知树梢序列。

如何应用不是难点，作者见了一个服务器maxAlike - web server上去看看应该就会了。

maxAlike - web server地址

http://rth.dk/resources/maxAlike/submit

 为了图文并茂，请下载pdf文件观看

使用maxAlike - web server重建未知序列.pdf

可能对大多数读者来说，难点在于这到底是个什么样的过程。

下面我们就来简单图示一下

有如下已经使用其它分子标记或者形态数据构建的树

包括了A到F，6个物种

现在我们手里有A、B、D、E、F，5个物种的某个分子序列，如下图

如果想推测物种C的该分子序列，就可以使用maxAlike - web server了

就这么简单，祝您科研愉快。

 

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