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基因组学研究的数据分析之六:从fasta文件中提取信息
热度 1 袁铁铮 2012-12-28 01:12
基因组学研究的数据分析之六:从fasta文件中提取信息 从 .fasta 文件中提取信息 在生物学研究中会经常遇见 fasta 格式文件,下面是一个 fasta 格式文件的例子,一条序列信息分两行,第一行以 开头包括序列相关的注释信息,第二行就是 DNA 或蛋 ...
9466 次阅读|1 个评论 热度 1
基因组学研究的数据分析之五:Perl编程之数据排序
袁铁铮 2012-12-21 04:47
基因组学研究的数据分析之五: perl 之排序 在数据分析中经常会用到排序,使用 Perl 编程时,一个最简单的排序如下: @array= sort @array; 该语句等同于: &n ...
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基因组学研究的数据分析之四:数据下载和文件备份
袁铁铮 2012-9-1 01:08
“如何建立基因组学研究的数据分析平台?”之 数据下载和文件备份 下载数据 下面例子是从 NCBI 的 FTP 站点中下载人类基因组数据,并保存到 /data 目录下, -r 表示递归下载, -k 表示使用相对路径, -c 表示断点续传 ...
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基因组学研究的数据分析之三:MySQL数据库
袁铁铮 2012-9-1 00:44
“如何建立基因组学研究的数据分析平台?”之 MySQL 数据库 数据库启动和关键目录 MySQL 数据库在 linux 下是默认安装的, MySQL 的守护进程是 mysqld, 如果已经安装则输入如下命令启动数据库服务: ...
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基因组学研究的数据分析之二:安装和配置Linux系统
袁铁铮 2012-9-1 00:32
“如何建立基因组学研究的数据分析平台?”之 安装和配置 Linux 系统 本文目的是帮助只有生物学背景的研究者尽快搭建一个 Linux 工作平台,够用就行,篇幅所限仅提供关键信息点,详细学习请自行阅读相关书籍。 系统规划 &nb ...
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基因组学研究的数据分析之一:学习相关领域的书籍
热度 1 袁铁铮 2012-7-26 15:32
“如何建立基因组学研究的数据分析平台?”之 学习相关领域的书籍 关于学习,我的第一个建议是花一点时间凝练出需要解决的生物学问题,目的是找到学习的方向,只要能有助于解决问题,就要创造条件开始学习,即使自己是门外汉,另外一些与解决问题 ...
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如何建立基因组学研究的数据分析平台?
热度 3 袁铁铮 2012-7-16 10:20
如何建立基因组学研究的数据分析平台? 本文总结了本人在相关领域研究获得的经验和教训,主要涵盖开展基因组学以及转录组学和蛋白质组学方面的研究经验,注重实操性,自认为这些内容可能会为哪些想入行而又不得其门的初学者提供些许帮助。为此说明如下: l ...
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