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关于Linux系统cd-hit软件和probcons软件的解析

已有 4929 次阅读 2014-5-12 16:46 |系统分类:科研笔记|关键词:学者| Linux, cd-hit, probcons

cd-hit软件是华人科学家Weizhong Li开发的一个快速去除冗余序列的软件,不仅速度快且准确度高,至于软件的详细介绍,科学网博主高山流水已在其博客中做了介绍(address:http://blog.sciencenet.cn/blog-54276-466940.html)其实对于了解linux的人而言,make其实是一个非常简单的步骤,但对于像我这样的Linux小白而言,却也算是一个难题 ),具体的解析操作如下:

首先在官网中下载cd-hit压缩包,将其解压之后(可放于任意位置),文件夹命名为cd-hit,然后右击鼠标,选择复制到主文件夹。 打开Linux系统的命令输入窗口,输入cd cd-hit.回车,再输入make即可完成软件的解析。

我对于probcons也是按照上述步骤解析,但系统提示如下错误:

"strcmp" was not declared in the scope.

对于这样错误,各位可以打开文件夹中的Main.cc文件,将include<string>更改为include<cstring>,重新按照上述步骤操作即可。

注:该博文是一个Linux系统初学者针对初学者的一个交流,对于稍微入门的学者而言就是废话,大家完全可以不必理会。



https://m.sciencenet.cn/blog-1334016-793764.html


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