育种数据分析之放飞自我分享 http://blog.sciencenet.cn/u/yijiaobai 关注:生物统计,数量遗传,混合线性模型,生物信息,R,Perl,Python,GWAS,GS相关方法,文章及代码

博文

按标题搜索
GenStat软件介绍
2016-1-11 11:17
GenStat GenStat历史悠久,20世纪60年代由英国洛桑试验站的科学家们研发,不断更新完善的产品功能使其始终活跃于生物统计学技术的最前沿 。GenStat的升级更新都紧紧围绕农业科学家的科研需求,包括 方差分析 、 试验设计 、大量的多变量分析技术及线性混合模型分析。软件广泛应用于 植物学 、 生态学 、资源环境 ...
个人分类: 翻译博客|14436 次阅读|没有评论
QTL与环境互作 文献解读
2016-1-7 10:01
芜菁在不同干旱处理下考察开花前生理生态性状相关 QTL 与环境的互作 Genotype–environmentinteractions affecting preflowering physiological and morphological traits ofBrassica rapa grown in two watering regimes 物种:芜菁 期刊: Journalof Experimental Botany 影响因子: 5.79 发表单位:瓦赫宁根大 ...
个人分类: 农学统计|4263 次阅读|没有评论
双标图GGE分析在农作物品种多点试验中的应用(综述)
2016-1-7 09:39
杂志:作物学报 发表单位:加拿大农业部加东粮油中心 发表时间: 2010 年 8 月 双标图经常用于农作物多点试验的数据分析,严威凯老师开发了一个名为 GGE-biplot 的软件,但软件没有相关的使用教程,操作不便, GenStat 软件完全可以实现它的功能。本次文献解读介绍怎么用 GenStat 实现 GGE 双标图。 ...
个人分类: 农学统计|4852 次阅读|没有评论
SAS、SPSS、R和GenStat分析裂区试验数据 代码、模型干货分享
2015-12-30 21:34
SAS、SPSS、R和GenStat在裂区试验数据 分析中如何实现 结论: 1、四种软件结果再平衡数据(没有缺失值)的情况下是一致的。 2、SAS和R进行多重比较时比较麻烦。 3、SPSS根本就无法对交互作用的因子进行多重比较,而且多重比较的形式乖乖的。 4、GenStat操作最简单,结果最直观。 ps:如果想咨询数据分析的问题,请 ...
个人分类: 农学统计|7591 次阅读|没有评论
不完全双列杂交NCⅡ设计的数据处理方法
2015-12-28 10:52
不完全双列杂交 NC Ⅱ设计的数据处理方法 在育种过程中,经常需要通过试验设计评价种质资源的遗传特性 , 培育和引进自交系的好坏,不完全双列杂交用于评价种质遗传结构和配合力十分有用。 不完全双列杂交是指把供试亲本按试验要求分为两组,只进行组间杂交,不进行组内杂交。 在培育品种的过程中,常 ...
个人分类: 农学统计|9087 次阅读|没有评论
一年多点、一点多年、多年多点的数据分析,计算品种的blup值
热度 1 2015-11-17 20:28
数据来源: year_location_data.csv 这是一个农作物产量的数据,为多年多点数据,目的是为了计算品种的blup值。 分为两个地点:北京和上海 两个年份:2009和2010 四个观测值:trait_1-4 数据格式如下:数据分析为品种、重复、年份、地点和四种性状,数据有缺失值,用*号表示,如下所示: 用到的软件:GenSta ...
个人分类: 农学统计|10462 次阅读|1 个评论 热度 1
更新博客计划
2015-9-29 14:29
1、更新我的博客,一周至少一次 2、自言自语之地,靠谱的地方 3、学习思考之地 4、一己之见之地 5、随感之地
个人分类: 随感|2014 次阅读|没有评论
遗传方差成分估计(Estimated variance components)
2015-7-5 12:46
有时也翻译为方差分量,今天弄明白什么意思了,以一个示例说明: 参考孔繁玲编著《植物数量遗传学》第六章,遗传交配设计与遗传方差成分估计,例6.1所示,是评价玉米自交系群体的变异情况,从群体中随机取出8个有代表性的自交系,以4次重复的随机完全区组设计作田间试验考察小区产量, 数据如下: kong-fan-ling-varian ...
个人分类: 农学统计|9467 次阅读|没有评论
用GenStat处理二因素随机区组并做多重比较
2015-7-4 18:39
二因素随机区组并做多重比较: excel太复杂 SPSS没有区组的概念,而且对于交互作用的多重比较,还要通过编程去做 DPS可以做,但是格式古板,而且缺乏伸展性,国外认可度低 看一下专门做农业统计的软件GenStat怎么做。 数据: 农业上查看氮和硫不同浓度产量的影响,其中N有3个水平,S有4个水平,区组有3个,部 ...
个人分类: 农学统计|3355 次阅读|没有评论

本页有 1 篇博文因作者的隐私设置或未通过审核而隐藏

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-4-27 14:21

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部