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表面计算中的偶极修正
曾振华 2012-5-27 04:47
上次写了一点 Surface dipole moment and work function change , 下面再谈一点相关的问题,即表面计算中的偶极修正. 在第一原理计算建模中,表面通常是由一个若干层的slab加上一定厚度的真空层来模拟。真空层的存在是周期性边界条件决定的。周期性边界条件决意味着slab的images 会周期性的重复,而真空层的作用就是保证这 ...
个人分类: Techinique|5833 次阅读|没有评论
获取作业(job)PBS_O_WORKDIR的简单方法
曾振华 2012-1-24 05:38
PBS系统还是有很多的局限性,例如要获取job的PBS_O_WORKDIR, 要通过qstat -f jobid 来完成,这一命令给出大量的信息,但是要想获取PBS_O_WORKDIR, 还要做一些copy, paste操作。如果天天这么做也够烦的。下面是一个简单的脚本,可以实现这个目的。 例如把这些命令认放到一个名为qdir的脚本文件中,chmod +x qdir 后,执行qdi ...
个人分类: Techinique|7325 次阅读|没有评论
qsub (PBS) 两个很好用的功能
曾振华 2011-7-28 22:53
高性能计算中大家用qsub提交作业 qsub job_script, 如果利用好两个功能,可达到事半功倍。 (1) qsub -a yyyymmddhhmmss job_script 或者 sub hhmm job_script 指定作业从某年某月某日某时某分某秒开始执行 或者从当天某时某分开始。 (2) qsub -W depend=afterok:job_id job_script 指定作业在前一作业(id)无错结束后 ...
个人分类: Techinique|7123 次阅读|没有评论

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