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膜蛋白分子扩散运动模型
从单分子追踪(SPT)技术获得的单分子轨迹中,可以计算单分子扩散的均方位移(MSD:mean square displacement),一般说来,该均方位移是单分子三维扩散运动的函数,我们这里只介绍二维扩散运动(膜运动)的形式。
根据MSD的不同,一般使用五种运动模型来描述膜蛋白的运动形式,分别是:
1) 稳态模型,也就是在观察时间内,蛋白分子几乎没有运动,在数量上定义为扩散系数D小于4.6X10-12cm2/s,如图中的A所示。
2) 布朗运动,蛋白分子进行简单地布朗运动,这种情况下,MSD-t曲线是一条直线,如图中的B所示。
3) 直线扩散运动,分子以一个固定的速度沿着某个固定的方向进行扩散运动,同时叠加一个随机的扩散运动,,如图中的C所示。
4) 受限运动,这时分子是在一个受限的区域内进行布朗运动。直观地说,当膜蛋白陷在某个膜区内时,就会发生这种扩散运动,比如由蛋白骨架设定的膜区,如图中的D所示。这种情况下,我们通过对MSD曲线的拟合,可以获得模糊系数D、运动速度和约束区间尺度等重要信息。
5) 障碍扩散,这时蛋白分子的扩散运动受到周围其它障碍物的影响,而随着障碍物的不同,这种扩散也呈现出不同的运动轨迹,如图中的E、F所示。
应该注意到,上述是基于统计意义上的五种蛋白分子扩散运动分类模型,而实际上,由于所处细胞环境的复杂性和不断变化,分子往往呈现几种运动模型的混合状态。
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GMT+8, 2024-5-19 13:29
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