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- Discovery Studio官方教程（Help-Tutorials） 定义蛋白活性位点以进行分子对接
- 目的： 采 用Discovery Studio，以一个蛋白为实例，示范 定义受体 结合位点的操作过程。 所需功能和模块： Discovery Studio Visualizer client 所需数据文件： 1kim.pdb 所需时间： 10 分钟 介绍 受体结合位点的定义对于分子对接和打分都非常重要。 寻找结合位点有两种方法：在 ...
- Discovery Studio官方教程（Help-Tutorials） 可视化分子对接非键作用
- 所需功能和模块： Discovery Studio Client 所需数据文件： 3pwh_dockedposes.dsv 所需时间： 20 分钟 介绍 分子之间的非键相互作用是生命体系中分子识别的基础。在基于结构的药物设计过程中，识别和优化配体分子和受体分子间的相互作用是一个基本过程，因此，全面细致的分析非键相互作用 ...
- Discovery Studio官方教程（Help-Tutorials） 拉伸动力学计算结合自由能
- 目的： 采用拉伸动力学计算结合能。 所需功能和模块： Discovery Studio Client, DS CHARMm 。 所需数据文件： 3HTB.pdb 所需时间： 0.5 小时+SMD时间（使用单核大约9小时） 介绍 拉伸分子动力学模拟可以使原来在微妙至秒时间范围内发生的生物物理过程在纳秒尺度内进行模拟，从而动 ...
- Discovery Studio官方教程（Help-Tutorials） 构建基于分子共同特征的药效团模型
- 目的： 通过此教程，了解Discovery Studio中构建基于分子共同特征的药效团的操作方法及结果分析。 所需功能和模块： Discovery Studio Client ，DS Catalyst Conformation，DS Catalyst Hypothesis，DS Catalyst Score。 所需数据文件： 5HT2c_ligands.sd ，sulfonamide5HT2c_ligands.sd，sampledrugs2 ...
- Discovery Studio官方教程（Help-Tutorials） 构建具有活性预测能力的3D QSAR药效团
- 目的： 通过此教程，了解Discovery Studio中构建具有活性预测能力的药效团的操作方法及结果分析。 所需功能和模块： Discovery Studio Client ，DS Catalyst Conformation，DS Catalyst Hypothesis，DS Catalyst Score。 所需数据文件： serm_ligands.sd ，test_serm_ligands.sd。 所需时间： 3 ...
- Discovery Studio官方教程（Help-Tutorials） 基于MODELER构建抗体模型
- 抗体3D结构的预测（MODEL ANTIBODIES）教程 目的： 通过此教程，了解Discovery Studio中基于抗体序列构建抗体全长及Framwork区模型的操作方法及结果分析。 所需功能和模块： Discovery Studio Client ，DS Sequence Analysis，DS MODELER，DS Protein Families，DS Validate Protein Structure。 所 ...
- Discovery Studio官方教程（Help-Tutorials）基于MODELER构建蛋白酶模型
- 基于蛋白序列构建同源蛋白模型（MODELER）教程 目的： 通过此教程，了解Discovery Studio中基于蛋白序列构建同源蛋白模型的操作方法及结果分析。 所需功能和模块： Discovery Studio Client ，DS Sequence Analysis，DS MODELER，DS Protein Families， DS Protein Health 。 所需数据文件： P41 ...
- Discovery Studio官方教程（Help-Tutorials） 基于MODELER构建膜蛋白模型
- 基于蛋白序列构建同源跨膜蛋白模型教程 目的： 通过此教程，了解Discovery Studio中基于蛋白序列构建同源跨膜蛋白模型的操作方法及结果分析。 所需功能和模块： Discovery Studio Client ，DS Sequence Analysis，DS MODELER，DS Protein Families。 所需数据文件： 2rh1.pdb ，ADRB1_HUMAN.fasta ...
- Discovery Studio官方教程（Help-Tutorials） 丙氨酸扫描、饱和突变指导蛋白理性设计
- 虚拟氨基酸突变（Calculate Mutation Energy）教程 目的： 通过此教程，了解Discovery Studio中虚拟氨基酸突变的操作方法及结果分析。 所需功能和模块： Discovery Studio Client ，DS CHARMm 所需数据文件： 1aq1.pdb ，2sta_I.pdb 所需时间： 60 分钟 介绍 蛋白的氨基酸定 ...
- Discovery Studio官方教程（Help-Tutorials） 预测突变形成二硫键改造蛋白质
- 目的： 通过此教程，了解Discovery Studio中预测蛋白质二硫键的操作过程。 所需功能和模块： Discovery Studio Client 所需数据文件：2CBA.dsv 所需时间： 1 小时 介绍 蛋白质通过选择性的氨基酸突变形成二硫键，可能增强蛋白质稳定性。然而稳定的突变位点不仅仅由空间距离决定。稳定 ...
