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BLAST(NCBI)序列比对结果解释小记

已有 2395 次阅读 2023-6-10 13:14 |系统分类:科研笔记

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Query Sequence    |    Subject Sequence

Blast (见下图):

1. GapsQuerySbjct比对缺失的碱基个数(即比对不一致碱基和一致性碱基之外的碱基) 比对一致性序列总长

Gaps = 5比对一致性序列总长

2. IdentitiePer.identQuerySbjct完全比对上的碱基个数 比对一致性序列总长

Identitie = 39比对一致性序列总长

3. QueryCover是比对Query的实际长度 / Query实际总长

QueryCover = 57 / Query实际总长

备注:每行长度60

image.png


【参考】

BLAST: Basic Local Alignment Search Tool (nih.gov)



https://m.sciencenet.cn/blog-994715-1391248.html

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