细胞培养过程中交叉污染的概率

据ATCC估计，1977年错误使用细胞的概率是16%，1999年是18%。根据我们的经验，国内细胞系用错的概率不低于20%；即如果一个研究所有二十个课题组，按概率估计，有4个课题组用的细胞是错的。

2017年，武汉大学病毒学国家重点实验室发表了一篇文章，主题便是“278株常见人源肿瘤细胞系的交叉污染及错误鉴定（Investigation of Cross-Contamination and Misidentification of 278 Widely Used Tumor Cell Lines）”，该实验室采用STR分型方法进行细胞系遗传背景鉴定，结果得到了一个可怕的结果。

作者分别从国内28个研究机构搜集了278株常见人源肿瘤细胞系，其中国内建立的细胞系71株，国外建立的细胞系207株。经STR鉴定后发现，来自于22个研究机构的128株细胞存在交叉污染／错误鉴定的情况，错误率高达46%。其中国内建立的细胞系占52株，这表明了什么，国内建立的细胞系交叉污染／错误鉴定率竟然高达73.2%，并且67.3%（35/52）国内交叉污染／错误鉴定的细胞系结果被证实是Hela细胞或被Hela细胞部分污染的！

种内细胞交叉污染检测

STR基因分型比对数据库结果示例

小鼠细胞系：翼和生物利用荧光PCR扩增小鼠基因组中9个STR基因座位，PCR产物在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测进行基因分型。同时加入1个人源STR位点，同步排查人源细胞系交叉污染。根据所得的STR分型结果与细胞STR数据库（Expasy）比对，从而鉴定样本所数的小鼠细胞系。

种间细胞交叉污染检测

上海翼和生物为客户提供基于qPCR技术的种系鉴定方案，选择人、小鼠、大鼠和仓鼠基因组中特异基因片段，设计引物和荧光探针，快速鉴定种系来源。该方案灵敏度和特异性高，可以检测样本中不同种系来源的细胞污染，当污染细胞占比> 5% 时，可被稳定检出。

Panel2 大鼠仓鼠体系：只有大鼠、仓鼠样本会扩增，人源、小鼠不扩增；蓝色为仓鼠扩增曲线，红色为大鼠扩增曲线。

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